ДУРБАН: Врачи и медсестры в группе южноафриканских больниц заметили странный всплеск числа пациентов с Covid-19 в своих палатах в конце октября. Правительство ослабило свою ограничительную хватку, и весна принесла больше вечеринок. Но цифры росли слишком быстро, чтобы их было легко объяснить, что вызвало тревожный вопрос.
«Это другой сорт?» — спросил один из сотрудников больницы в групповом электронном письме в начале ноября, подняв вероятность того, что у вируса возникла опасная мутация.
Этот вопрос положил начало важному генетическому исследованию, которое началось здесь, в Дурбане, в Индийском океане, послужило толчком для исследователей в Великобритании и теперь проводится по всему миру. Ученые обнаружили новые вызывающие беспокойство варианты вируса, которые привели к закрытию границ, карантину и карантину, а также ослабили энтузиазм, вызванный вакцинами.
Британия была особенно поражена. В последние недели резко возросло количество инфекций и госпитализаций, поскольку в этой стране был обнаружен собственный вариант вируса, который более заразен, чем предыдущие формы. По некоторым оценкам, мутировавший вирус уже является причиной более 60% новых случаев заражения в Лондоне и его окрестностях.
Коронавирус эволюционировал по мере своего распространения по миру, как и любой другой вирус. Но эксперты были поражены темпами появления значительных новых вариантов, что еще более усилило гонку между лучшими в мире защитными средствами — вакцинацией, изоляцией и социальным дистанцированием — и агрессивным, постоянно меняющимся противником.
Новый вариант, поражающий Великобританию, уже был обнаружен примерно в 45 странах, от Сингапура до Омана и Ямайки, но многие страны фактически летят вслепую, не имея большого представления о том, насколько серьезной может быть проблема.
Задолго до начала пандемии официальные лица здравоохранения призывали к регулярному генетическому надзору за вспышками. Но, несмотря на годы предупреждений, многие страны, включая Соединенные Штаты, проводят лишь часть геномных исследований, необходимых для определения распространенности мутаций вируса.
Дания, которая инвестировала в генетический надзор, обнаружила вариант, поражающий Великобританию во многих датских регионах, и недавно ужесточила ограничения. Министр здравоохранения сравнил это со штормовым нагоном, прогнозируя, что к середине февраля он будет преобладать над другими вариантами.
И по мере того, как страны ищут, они открывают и другие варианты.
В условиях, когда мир спотыкается в развертывании вакцинации, а количество случаев резко возрастает до пиков, превышающих показатели прошлой весны, ученые видят насущную необходимость иммунизировать как можно больше людей, прежде чем вирус разовьется настолько, чтобы вакцины стали бессильными.
«Это гонка со временем», — сказала Марион Купманс, голландский вирусолог и член рабочей группы Всемирной организации здравоохранения по адаптации к коронавирусу.
Одной вакцины будет недостаточно, чтобы опередить вирус. Потребуются годы, чтобы привить достаточно людей, чтобы ограничить его развитие. Между тем, социальное дистанцирование, ношение масок и мытье рук — в сочетании с агрессивным тестированием, отслеживанием и отслеживанием — могут выиграть время и предотвратить разрушительные всплески госпитализаций и смертей на этом пути. По мнению экспертов, эти стратегии все еще могут переломить ситуацию с вирусом.
«Мы действительно знаем, как снизить передачу вируса с помощью нашего поведения», — сказал Карл Бергстром, биолог-эволюционист из Вашингтонского университета в Сиэтле. «У нас там много агентств».
Однако в ходе пандемии правительства часто оказывались неохотно или неспособными мобилизовать поддержку этих основных средств защиты. Многие страны почти отказались от отслеживания и отслеживания. Ношение масок по-прежнему остается политически мотивированным в Соединенных Штатах, несмотря на явные доказательства его эффективности. Такие города, как Лос-Анджелес, охвачены всплеском случаев, связанных с рождественскими праздниками, а национальные чиновники здравоохранения готовятся к всплеску в других местах, движимом людьми, которые игнорировали советы и путешествовали во время праздников.
Многое остается неизвестным о новых вариантах или даже о том, сколько из них прорастает по всему миру. Ученые спешат отследить достаточно вируса, чтобы знать, но лишь у нескольких стран есть средства или обязательства для этого.
Быстрое распространение вариантов является напоминанием о более ранних неудачах и ошибках крупных стран в сдерживании вируса. Подобно тому, как Китаю не удалось остановить распространение вируса перед Лунным Новым годом в прошлом году, Великобритания не смогла достаточно быстро опередить распространение нового варианта. Британия ослабила бдительность во время праздников, несмотря на рост числа случаев, которые, как теперь известно, связаны с этим вариантом. И точно так же, как Китай на раннем этапе стал изгоем, Британия получила досадное отличие — ее называют Островом Чумы.
Распространение варианта нападения на Британию сделало некоторые страны уязвимыми в то время, когда они казались на грани научного спасения. Показательный пример: Израиль. Страна, которая запустила чрезвычайно успешное внедрение вакцины, в пятницу ужесточила карантин после обнаружения случаев этого варианта. В последние дни выявляется около 8000 новых случаев заражения в день, а скорость распространения в ультраортодоксальных общинах резко возросла.
Вариант, обнаруженный в Великобритании, известный как B.1.1.7, имеет 23 мутации, которые отличаются от самой ранней известной версии вируса в Ухане, Китай, включая одну или несколько, которые делают его более заразным, и, по крайней мере, одну, которая немного ослабляет вакцины. ‘потенция. Некоторые эксперименты предполагают, что этот вариант распространяется легче, потому что мутации позволяют ему более успешно закрепляться в дыхательных путях человека.
Бергстром и другие ученые были удивлены появлением этого более заразного варианта, учитывая, что коронавирус уже достаточно хорошо умел заражать людей. Но другие эксперты с самого начала предупреждали, что это будет лишь вопросом времени, когда вирус станет еще более грозным противником.
«Каждая тщательно изученная нами ситуация, когда вирус переходит в новый вид, со временем становится более заразным», — сказал Эндрю Рид, микробиолог-эволюционист из Университета штата Пенсильвания. «Он развивается из-за естественного отбора, чтобы стать лучше, и вот что здесь происходит».
Большая часть глобальных ответных мер была сосредоточена на закрытии Британии с помощью мешанины национальных ограничений, которые восходят к ранним реакциям на эпидемию.
Эксперты говорят, что вместо этого странам следует сосредоточиться на увеличении вакцинации, особенно среди основных работников, которые подвергаются высокому риску и не имеют ресурсов для защиты. Чем дольше вирус распространяется среди непривитых, тем больше мутаций он может собрать, что может снизить эффективность вакцины.
Вот почему, когда рабочая группа ВОЗ увидела первые данные о варианте, циркулирующем в Южной Африке 4 декабря, все обратили внимание.
«Ваш следующий сразу же вопрос: могут ли вакцины защитить нас, если мы получим вирусы с этими мутациями?» — сказал Купманс, присутствовавший на встрече.
На данный момент ответ кажется положительным, сказал Джесси Блум, биолог-эволюционист из Центра исследования рака Фреда Хатчинсона в Сиэтле. Купманс соглашается.
Варианты, появившиеся в Южной Африке и Бразилии, представляют особую угрозу для усилий по иммунизации, поскольку оба содержат мутации, связанные со снижением эффективности вакцин. В одном эксперименте, предназначенном для выявления наихудшего сценария, команда Блума проанализировала 4000 мутаций в поисках тех, которые сделали бы вакцины бесполезными. Наибольшее влияние оказала мутация в вариантах из Бразилии и Южной Африки.
Тем не менее, каждый образец сыворотки в исследовании нейтрализовал вирус, независимо от мутации, сказал Блум, добавив, что потребуется несколько лет, прежде чем вакцины потребуется изменить. «У нас должно быть достаточно времени, чтобы быть перспективным, выявить эти мутации и, возможно, вовремя обновить вакцины», — сказал он.
Именно такое наблюдение привело к открытию новых вариантов.
Лиза Ситхарам, медсестра и специалист по инфекционным заболеваниям из прибрежной части Южной Африки, была среди тех, кто впервые заметил небольшой кластер, который быстро увеличивался. «У нас будет пять дел, а потом их очень быстро удвоится», — вспоминает она. По ее словам, грубые цифры не вызывают тревогу, но «что-то просто не так».
Ее руководитель в группе больниц Netcare, доктор Кэролайн Масло, решила, что с открытыми границами страны деловые путешественники из немецких автомобильных компаний, возможно, привезли европейский вариант. Она обратилась за помощью к Тулио де Оливейре, профессору и генетику из Медицинской школы Нельсона Манделы в Дурбане, который изучал вирусные варианты во время первой волны Covid-19.
Вскоре его лаборатория занималась анализом мазков, доставленных по льду курьером в течение ночи. 1 декабря он отправил электронное письмо британскому ученому Эндрю Рамбо и попросил его пересмотреть некоторые ранние открытия: серию странных мутаций на внешней поверхности вируса.
Де Оливейра, бразильский южноафриканский ученый, у которого длинные волосы и увлекается серфингом, поделился своими выводами на заседании рабочей группы ВОЗ 4 декабря. Все обратили внимание на то, что варианты могут нарушить эффективность вакцин.
Спустя несколько дней, как он вспомнил, Рамбо отправил ему по электронной почте свое собственное открытие: британские ученые просмотрели свои базы данных и обнаружили похожую, но не связанную мутацию, которая, по-видимому, была связана с кластером инфекций в графстве Кент.
Это было за две недели до Рождества, и де Оливейра сразу подумал о Лунном Новом году в начале пандемии, когда миллионы людей в Китае путешествовали повсюду на праздник, некоторые из них были носителями вируса. «Это было предельно ясно», — сказал де Оливейра в интервью. «Эти варианты будут распространяться на национальном, региональном и глобальном уровнях».
Рамбау и его коллеги опубликовали документ о варианте, обнаруженном в Великобритании 19 декабря — в тот же день, когда британские официальные лица объявили о новых мерах. По всей видимости, этот вариант незамеченным распространялся еще в сентябре. С тех пор Рамбау приписал команде Южной Африки наводку, которая привела к открытию этого варианта в Великобритании.
Представители общественного здравоохранения официально рекомендовали этот тип быстрого генетического надзора и обмена информацией в качестве одного из ключей к тому, чтобы оставаться на вершине постоянно меняющегося вируса. Но они уже много лет призывают к такому рутинному наблюдению, и результаты неоднозначны.
«Послание было очень четким, что надзор должен идти именно так, — сказал д-р Хосеп Янса, старший научный сотрудник Европейского центра профилактики и контроля заболеваний. Подобно тому, как год назад Covid-19 выявил недостатки в планах борьбы с пандемией в мире, охота за новыми вариантами выявляет пробелы в наблюдении. «Мы учимся», — сказал он. «Медленно.»
В Великобритании действует одна из самых агрессивных схем эпиднадзора, в которой анализируется до 10% проб, дающих положительный результат на вирус. Но немногие страны имеют такие надежные системы. Соединенные Штаты секвенируют менее 1% положительных образцов. А другие не могут надеяться на приобретение оборудования или создание таких сетей вовремя для этой пандемии.
В Бразилии лаборатории, которые перенаправили свое внимание с вируса Зика на коронавирус, уже этой весной обнаружили там тревожную мутацию. Но мало что известно о вариантах, циркулирующих в стране, или о том, как быстро они распространяются. «Мы просто не знаем, потому что никто не секвенирует и не делится данными», — сказал доктор Нуно Фариа из Имперского колледжа и Оксфордского университета, который координирует проекты геномного секвенирования с коллегами из Бразилии. «Геномный надзор стоит дорого».
По мере того как вирус продолжает мутировать, почти наверняка появятся другие важные варианты. По словам Рида, те, которые делают вирус более стойким или заразным, с большей вероятностью будут распространяться. «Чем быстрее мы получим вакцины, тем быстрее мы сможем победить эти варианты», — сказал он. «Здесь нет места для самоуспокоенности».
«Это другой сорт?» — спросил один из сотрудников больницы в групповом электронном письме в начале ноября, подняв вероятность того, что у вируса возникла опасная мутация.
Этот вопрос положил начало важному генетическому исследованию, которое началось здесь, в Дурбане, в Индийском океане, послужило толчком для исследователей в Великобритании и теперь проводится по всему миру. Ученые обнаружили новые вызывающие беспокойство варианты вируса, которые привели к закрытию границ, карантину и карантину, а также ослабили энтузиазм, вызванный вакцинами.
Британия была особенно поражена. В последние недели резко возросло количество инфекций и госпитализаций, поскольку в этой стране был обнаружен собственный вариант вируса, который более заразен, чем предыдущие формы. По некоторым оценкам, мутировавший вирус уже является причиной более 60% новых случаев заражения в Лондоне и его окрестностях.
Коронавирус эволюционировал по мере своего распространения по миру, как и любой другой вирус. Но эксперты были поражены темпами появления значительных новых вариантов, что еще более усилило гонку между лучшими в мире защитными средствами — вакцинацией, изоляцией и социальным дистанцированием — и агрессивным, постоянно меняющимся противником.
Новый вариант, поражающий Великобританию, уже был обнаружен примерно в 45 странах, от Сингапура до Омана и Ямайки, но многие страны фактически летят вслепую, не имея большого представления о том, насколько серьезной может быть проблема.
Задолго до начала пандемии официальные лица здравоохранения призывали к регулярному генетическому надзору за вспышками. Но, несмотря на годы предупреждений, многие страны, включая Соединенные Штаты, проводят лишь часть геномных исследований, необходимых для определения распространенности мутаций вируса.
Дания, которая инвестировала в генетический надзор, обнаружила вариант, поражающий Великобританию во многих датских регионах, и недавно ужесточила ограничения. Министр здравоохранения сравнил это со штормовым нагоном, прогнозируя, что к середине февраля он будет преобладать над другими вариантами.
И по мере того, как страны ищут, они открывают и другие варианты.
В условиях, когда мир спотыкается в развертывании вакцинации, а количество случаев резко возрастает до пиков, превышающих показатели прошлой весны, ученые видят насущную необходимость иммунизировать как можно больше людей, прежде чем вирус разовьется настолько, чтобы вакцины стали бессильными.
«Это гонка со временем», — сказала Марион Купманс, голландский вирусолог и член рабочей группы Всемирной организации здравоохранения по адаптации к коронавирусу.
Одной вакцины будет недостаточно, чтобы опередить вирус. Потребуются годы, чтобы привить достаточно людей, чтобы ограничить его развитие. Между тем, социальное дистанцирование, ношение масок и мытье рук — в сочетании с агрессивным тестированием, отслеживанием и отслеживанием — могут выиграть время и предотвратить разрушительные всплески госпитализаций и смертей на этом пути. По мнению экспертов, эти стратегии все еще могут переломить ситуацию с вирусом.
«Мы действительно знаем, как снизить передачу вируса с помощью нашего поведения», — сказал Карл Бергстром, биолог-эволюционист из Вашингтонского университета в Сиэтле. «У нас там много агентств».
Однако в ходе пандемии правительства часто оказывались неохотно или неспособными мобилизовать поддержку этих основных средств защиты. Многие страны почти отказались от отслеживания и отслеживания. Ношение масок по-прежнему остается политически мотивированным в Соединенных Штатах, несмотря на явные доказательства его эффективности. Такие города, как Лос-Анджелес, охвачены всплеском случаев, связанных с рождественскими праздниками, а национальные чиновники здравоохранения готовятся к всплеску в других местах, движимом людьми, которые игнорировали советы и путешествовали во время праздников.
Многое остается неизвестным о новых вариантах или даже о том, сколько из них прорастает по всему миру. Ученые спешат отследить достаточно вируса, чтобы знать, но лишь у нескольких стран есть средства или обязательства для этого.
Быстрое распространение вариантов является напоминанием о более ранних неудачах и ошибках крупных стран в сдерживании вируса. Подобно тому, как Китаю не удалось остановить распространение вируса перед Лунным Новым годом в прошлом году, Великобритания не смогла достаточно быстро опередить распространение нового варианта. Британия ослабила бдительность во время праздников, несмотря на рост числа случаев, которые, как теперь известно, связаны с этим вариантом. И точно так же, как Китай на раннем этапе стал изгоем, Британия получила досадное отличие — ее называют Островом Чумы.
Распространение варианта нападения на Британию сделало некоторые страны уязвимыми в то время, когда они казались на грани научного спасения. Показательный пример: Израиль. Страна, которая запустила чрезвычайно успешное внедрение вакцины, в пятницу ужесточила карантин после обнаружения случаев этого варианта. В последние дни выявляется около 8000 новых случаев заражения в день, а скорость распространения в ультраортодоксальных общинах резко возросла.
Вариант, обнаруженный в Великобритании, известный как B.1.1.7, имеет 23 мутации, которые отличаются от самой ранней известной версии вируса в Ухане, Китай, включая одну или несколько, которые делают его более заразным, и, по крайней мере, одну, которая немного ослабляет вакцины. ‘потенция. Некоторые эксперименты предполагают, что этот вариант распространяется легче, потому что мутации позволяют ему более успешно закрепляться в дыхательных путях человека.
Бергстром и другие ученые были удивлены появлением этого более заразного варианта, учитывая, что коронавирус уже достаточно хорошо умел заражать людей. Но другие эксперты с самого начала предупреждали, что это будет лишь вопросом времени, когда вирус станет еще более грозным противником.
«Каждая тщательно изученная нами ситуация, когда вирус переходит в новый вид, со временем становится более заразным», — сказал Эндрю Рид, микробиолог-эволюционист из Университета штата Пенсильвания. «Он развивается из-за естественного отбора, чтобы стать лучше, и вот что здесь происходит».
Большая часть глобальных ответных мер была сосредоточена на закрытии Британии с помощью мешанины национальных ограничений, которые восходят к ранним реакциям на эпидемию.
Эксперты говорят, что вместо этого странам следует сосредоточиться на увеличении вакцинации, особенно среди основных работников, которые подвергаются высокому риску и не имеют ресурсов для защиты. Чем дольше вирус распространяется среди непривитых, тем больше мутаций он может собрать, что может снизить эффективность вакцины.
Вот почему, когда рабочая группа ВОЗ увидела первые данные о варианте, циркулирующем в Южной Африке 4 декабря, все обратили внимание.
«Ваш следующий сразу же вопрос: могут ли вакцины защитить нас, если мы получим вирусы с этими мутациями?» — сказал Купманс, присутствовавший на встрече.
На данный момент ответ кажется положительным, сказал Джесси Блум, биолог-эволюционист из Центра исследования рака Фреда Хатчинсона в Сиэтле. Купманс соглашается.
Варианты, появившиеся в Южной Африке и Бразилии, представляют особую угрозу для усилий по иммунизации, поскольку оба содержат мутации, связанные со снижением эффективности вакцин. В одном эксперименте, предназначенном для выявления наихудшего сценария, команда Блума проанализировала 4000 мутаций в поисках тех, которые сделали бы вакцины бесполезными. Наибольшее влияние оказала мутация в вариантах из Бразилии и Южной Африки.
Тем не менее, каждый образец сыворотки в исследовании нейтрализовал вирус, независимо от мутации, сказал Блум, добавив, что потребуется несколько лет, прежде чем вакцины потребуется изменить. «У нас должно быть достаточно времени, чтобы быть перспективным, выявить эти мутации и, возможно, вовремя обновить вакцины», — сказал он.
Именно такое наблюдение привело к открытию новых вариантов.
Лиза Ситхарам, медсестра и специалист по инфекционным заболеваниям из прибрежной части Южной Африки, была среди тех, кто впервые заметил небольшой кластер, который быстро увеличивался. «У нас будет пять дел, а потом их очень быстро удвоится», — вспоминает она. По ее словам, грубые цифры не вызывают тревогу, но «что-то просто не так».
Ее руководитель в группе больниц Netcare, доктор Кэролайн Масло, решила, что с открытыми границами страны деловые путешественники из немецких автомобильных компаний, возможно, привезли европейский вариант. Она обратилась за помощью к Тулио де Оливейре, профессору и генетику из Медицинской школы Нельсона Манделы в Дурбане, который изучал вирусные варианты во время первой волны Covid-19.
Вскоре его лаборатория занималась анализом мазков, доставленных по льду курьером в течение ночи. 1 декабря он отправил электронное письмо британскому ученому Эндрю Рамбо и попросил его пересмотреть некоторые ранние открытия: серию странных мутаций на внешней поверхности вируса.
Де Оливейра, бразильский южноафриканский ученый, у которого длинные волосы и увлекается серфингом, поделился своими выводами на заседании рабочей группы ВОЗ 4 декабря. Все обратили внимание на то, что варианты могут нарушить эффективность вакцин.
Спустя несколько дней, как он вспомнил, Рамбо отправил ему по электронной почте свое собственное открытие: британские ученые просмотрели свои базы данных и обнаружили похожую, но не связанную мутацию, которая, по-видимому, была связана с кластером инфекций в графстве Кент.
Это было за две недели до Рождества, и де Оливейра сразу подумал о Лунном Новом году в начале пандемии, когда миллионы людей в Китае путешествовали повсюду на праздник, некоторые из них были носителями вируса. «Это было предельно ясно», — сказал де Оливейра в интервью. «Эти варианты будут распространяться на национальном, региональном и глобальном уровнях».
Рамбау и его коллеги опубликовали документ о варианте, обнаруженном в Великобритании 19 декабря — в тот же день, когда британские официальные лица объявили о новых мерах. По всей видимости, этот вариант незамеченным распространялся еще в сентябре. С тех пор Рамбау приписал команде Южной Африки наводку, которая привела к открытию этого варианта в Великобритании.
Представители общественного здравоохранения официально рекомендовали этот тип быстрого генетического надзора и обмена информацией в качестве одного из ключей к тому, чтобы оставаться на вершине постоянно меняющегося вируса. Но они уже много лет призывают к такому рутинному наблюдению, и результаты неоднозначны.
«Послание было очень четким, что надзор должен идти именно так, — сказал д-р Хосеп Янса, старший научный сотрудник Европейского центра профилактики и контроля заболеваний. Подобно тому, как год назад Covid-19 выявил недостатки в планах борьбы с пандемией в мире, охота за новыми вариантами выявляет пробелы в наблюдении. «Мы учимся», — сказал он. «Медленно.»
В Великобритании действует одна из самых агрессивных схем эпиднадзора, в которой анализируется до 10% проб, дающих положительный результат на вирус. Но немногие страны имеют такие надежные системы. Соединенные Штаты секвенируют менее 1% положительных образцов. А другие не могут надеяться на приобретение оборудования или создание таких сетей вовремя для этой пандемии.
В Бразилии лаборатории, которые перенаправили свое внимание с вируса Зика на коронавирус, уже этой весной обнаружили там тревожную мутацию. Но мало что известно о вариантах, циркулирующих в стране, или о том, как быстро они распространяются. «Мы просто не знаем, потому что никто не секвенирует и не делится данными», — сказал доктор Нуно Фариа из Имперского колледжа и Оксфордского университета, который координирует проекты геномного секвенирования с коллегами из Бразилии. «Геномный надзор стоит дорого».
По мере того как вирус продолжает мутировать, почти наверняка появятся другие важные варианты. По словам Рида, те, которые делают вирус более стойким или заразным, с большей вероятностью будут распространяться. «Чем быстрее мы получим вакцины, тем быстрее мы сможем победить эти варианты», — сказал он. «Здесь нет места для самоуспокоенности».
.
